生物导体版本:版本(3.15)
该软件包提供了“ HTSLIB” C库的1.7版,用于高通量序列分析。该软件包主要对希望使用HTSLIB的其他R软件包的开发人员有用。bob电竞体育官网使用此软件包的动机和说明在Vignette,Vignette(软件包=“ Rhtslib”,“ Rhtslib”)中。
作者:纳撒尼尔·海登(Nathaniel Hayden
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ Rhtslib”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rhtslib”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Rhtslib”)
| html | R脚本 | Rhtslib的动机和使用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
| 执照 | LGPL(> = 2) |
| 要看 | |
| 进口 | Zlibbioc |
| 链接 | Zlibbioc |
| 建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
| 系统要求 | libbz2&liblzma&libcurl(带有标题文件),GNU制作 |
| 增强 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhtslibhttp://www.htslib.org/ |
| BugReports | https://github.com/bioconductor/rhtslib/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Deepsnv,,,,Diffhic,,,,maftools,,,,线粒体2,,,,scpipe |
| 建议我 | |
| 链接到我 | arrayexpresshts,,,,bamsignals,,,,bitseq,,,,CSAW,,,,Deepsnv,,,,差异,,,,Diffhic,,,,Epialleler,,,,火焰,,,,H5VC,,,,maftools,,,,甲基库,,,,线粒体2,,,,podkat,,,,QRQC,,,,准,,,,RFASTP,,,,rsamtools,,,,scpipe,,,,seqbias,,,,Shortread,,,,transview,,,,变体 |
| 构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rhtslib_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rhtslib_1.28.0.zip(仅64位) |
| MacOS 10.13(高山脉) | rhtslib_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhtslib |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rhtslib |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rhtslib/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |