- 首页
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- Rhtslib
Rhtslib
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.Rhtslib
HTSlib高通量测序库作为R包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包提供了1.15.1版本的HTSlib C库，用于高通量序列分析。这个包主要对希望使用HTSlib的其他R包的开发人员有用。bob电竞体育官网使用此包的动机和说明在小插图中，小插图(包=“Rhtslib”，“Rhtslib”)。
作者:Nathaniel Hayden [led, aut]， Martin Morgan [aut]， Hervé Pagès [aut, cre]
维护者:Hervé Pagès
引文(从R内，输入引用(“Rhtslib”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Rhtslib”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Rhtslib的动机和使用 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport，测序，软件 |
| 版本 | 2.0.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年) |
| 许可证 | LGPL (>= 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | zlibbioc |
| 链接 | zlibbioc |
| 建议 | knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | libbz2 & liblzma & libcurl(带头文件)，GNU make |
| 增强了 | |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rhtslibhttp://www.htslib.org/ |
| BugReports | https://github.com/Bioconductor/Rhtslib/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | deepSNV，diffHic，maftools，mitoClone2，scPipe |
| 建议我 | |
| 链接到我 | ArrayExpressHTS，bamsignals，BitSeq，csaw，deepSNV，DiffBind，diffHic，epialleleR，火焰，h5vc，maftools，methylKit，mitoClone2，podkat，qrqc，QuasR，Rfastp，Rsamtools，scPipe，seqbias，ShortRead，TransView，VariantAnnotation |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Rhtslib_2.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Rhtslib_2.0.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | Rhtslib_2.0.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | Rhtslib_1.99.5.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rhtslib |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rhtslib |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rhtslib/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
