Bioconductor版本:Release (3.15)
BiocSet以三重tibble格式显示不同的生物集。这三个tibbles是' element ', ' set '和' elementset '。用户可以激活这三个tibble中的一个,以执行dplyr包中的通用功能。映射功能和访问元素/集的网络引用在bioset中也可用。
作者:Kayla Morrell [aut, cre], Martin Morgan [aut], Kevin Rue-Albrecht [ctb], Lluís Revilla Sancho [ctb]
维护者:Kayla Morrell < Kayla。roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(“BiocSet”)):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BiocSet”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | BiocSet:表示Tidyverse中的元素集 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6),dplyr |
| 进口 | 方法,宠物猫跑龙套,rlang,plyr,S4Vectors,BiocIO,AnnotationDbi,KEGGREST,ontologyIndex,tidyr |
| 链接 | |
| 建议 | GSEABase,气道,org.Hs.eg.db,DESeq2,limma,BiocFileCache,GO.db,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | RegEnrich |
| 进口我 | CBEA,麻雀 |
| 建议我 | dearseq |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | BiocSet_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BiocSet_1.10.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | BiocSet_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSet |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocSet |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BiocSet/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |