等位基因矛纪

DOI：10.18129 / b9.bioc.lellelicImbalance.

研究等位基因特异性表达

Bioconductor版本：释放（3.13）

提供了一种使用RNA-SEQ数据的等位基因特异性表达研究框架。

作者：Jesper R Gadin，Lasse Folkersen

维护者：Jesper R Gadin

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“AllelicImbalance”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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Browsevignettes（“AllelicImbalance”）

PDF.	r script.	等位基因平息小插图
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.30.0.
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（7.5岁）
执照	GPL-3
依靠	R（> = 4.0.0），网格，Genomicranges.（> = 1.31.8），概括分析（> = 0.2.0），基因管理（> = 1.15.6）
进口	方法，生物根系那annotationdbi.那bsgenome.（> = 1.47.3），VariantAnnotation.（> = 1.25.11），生物仪器（> = 2.47.6），S4Vectors.（> = 0.17.25），绞喉（> = 2.13.12），RSAMTOOLS.（> = 1.99.3），基因组法（> = 1.31.3），GVIZ.那格子那latticeextra.那格拉底那Seqinr.那genomeinfodb.那nlme.
链接到
建议	testthat.那org.hs.eg.db.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37.那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/pappewaio/leslicimbalance.
Bugreports.	https://github.com/pappewaio/allelicimbalance/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	AllelicimBalance_1.30.0.tar.gz.
Windows二进制文件	AllelicimBalance_1.30.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	AllelicimBalance_1.30.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/leslicimbalance.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/等位基因
包短网址	https://biocumon.org/packages/leslicimbalance/
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