SparseArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.SparseArray

多维稀疏阵列的有效内存中表示

Bioconductor版本:版本(3.17)

SparseArray包定义了SparseArray虚拟类延长其他S4类希望代表内存中的多维稀疏阵列。SVT_SparseArray阶级,就是这样一个扩展包中定义,提供了一个非零的高效表示多维数据通过小说布局称为“SVT布局”。SVT_SparseArray对象模仿普通矩阵或数组的行为在R尽可能多。特别是,他们最支架中定义的“标准阵列API”基地R。

作者:Herve页(aut (cre),文斯·凯里(曾经),拉斐尔·a·伊(曾经)

维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SparseArray”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SparseArray”)

HTML	R脚本	SparseArray对象
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文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.0.4
Bioconductor自	BioC 3.17 (r - 4.3)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	安装R(> = 4.3.0)、方法、矩阵,BiocGenerics(> = 0.43.1),MatrixGenerics(> = 1.11.1),S4Vectors,S4Arrays(> = 1.0.4)
进口	matrixStats统计数据,IRanges,XVector
链接	S4Vectors,IRanges,XVector
建议	DelayedArray,knitr testthat rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/SparseArray
BugReports	https://github.com/Bioconductor/SparseArray/issues
取决于我
进口我
建议我	MatrixGenerics,S4Arrays
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SparseArray_1.0.4.tar.gz
Windows二进制	SparseArray_1.0.4.zip
macOS二进制(x86_64)	SparseArray_1.0.4.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SparseArray
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SparseArray
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SparseArray/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SparseArray/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档