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zellkonverter
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DOI:10.18129 / B9.bioc.zellkonverter
scRNA-seq对象之间的转换
Bioconductor版本:发行版(3.16)
提供在Python AnnData对象和singlecel实验对象之间转换的方法。这些主要供下游Bioconductor包使用，这些包包装了用于单细胞数据分析的Python方法。它还包括读写用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的函数。
作者:Luke Zappia [aut, cre]
， Aaron Lun [aut]
维护者:Luke Zappia < Luke at lazappi.id.au>
引文(从R内，输入引用(“zellkonverter”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“zellkonverter”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 转换到/从AnnData到singlecel实验 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DataImport，DataRepresentation，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | 矩阵，蛇怪，网状，SingleCellExperiment(> = 1.11.6),SummarizedExperiment，DelayedArray、方法、S4Vectors跑龙套,cli |
| 链接 | |
| 建议 | anndata，BiocFileCache，BiocStyle，covr，HDF5Array，knitr，pkgload，rmarkdown，rhdf5，scRNAseq，拼写，testthat，withr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/theislab/zellkonverter |
| BugReports | https://github.com/theislab/zellkonverter/issues |
| 全靠我 | OSCA.intro |
| 进口我 | 伶盗龙 |
| 建议我 | cellxgenedp，HDF5Array |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | zellkonverter_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | zellkonverter_1.8.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | zellkonverter_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | zellkonverter_1.8.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/zellkonverter |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/zellkonverter/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/zellkonverter/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
