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tomoseqr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.tomoseqr
分析Tomo-seq数据的R包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
' tomoseqr '是一个用于分析Tomo-seq数据的R包。Tomo-seq是一种全基因组RNA断层扫描方法，将高通量RNA测序与冷冻切片相结合，用于空间分辨转录组学。' tomoseqr '从tomo-seq数据重建3D表达模式，并将重建的3D表达模式可视化。
作者:Ryosuke Matsuzawa [aut, cre]
维护:Ryosuke Matsuzawa
引文(从R内，输入引用(“tomoseqr”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tomoseqr")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“tomoseqr”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | tomoseqr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | GeneExpression，RNASeq，测序，软件，空间，转录组，可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.2) |
| 进口 | grDevices、图形动画，宠物猫，dplyr，stringr，purrr、方法、闪亮的，BiocFileCache，readr、工具、情节，ggplot2 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown，knitr，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | tomoseqr_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tomoseqr_1.2.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | tomoseqr_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | tomoseqr_1.1.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tomoseqr |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tomoseqr |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tomoseqr/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
