飞溅
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DOI:10.18129 / B9.bioc.splatter
单细胞RNA测序数据的简单模拟
Bioconductor版本:发行版(3.16)
Splatter是一个模拟单细胞RNA测序计数数据的软件包。它提供了一个简单的界面来创建复杂的模拟，这些模拟是可重复的，并且有良好的文档记录。参数可以从真实数据中估计，并提供了比较真实数据集和模拟数据集的函数。
作者:Luke Zappia [aut, cre]
，贝琳达·菲普森[au]，克里斯蒂娜·阿泽迪[ctb]——艾丽西亚·奥什莱克[au]
维护者:Luke Zappia < Luke at lazappi.id.au>
引文(从R内，输入引用(“飞溅”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“飞溅”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 飞溅包的介绍 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 飞溅模拟参数 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | splatPop模拟 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.0)，SingleCellExperiment |
| 进口 | BiocGenerics，BiocParallel，使彻底失败(> = 2.0.0),刨边机，fitdistrplus，ggplot2，locfit，matrixStats、方法、尺度，嘘(>= 1.15.16)， stats，SummarizedExperiment跑龙套,蜡笔，S4Vectors, grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，covr，cowplot，魔法，knitr，limSolve，lme4，进步，pscl，testthat，preprocessCore，rmarkdown，scDD，食物，mfa，phenopath，基础知识(> = 1.7.10),zinbwave，SparseDC，BiocManager，拼写，igraph，天窗，BiocSingular，VariantAnnotation，Biostrings，GenomeInfoDb，GenomicRanges，IRanges |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Oshlack/splatter |
| BugReports | https://github.com/Oshlack/splatter/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | bcTSNE,代币 |
| 建议我 | NewWave，司康饼，scPCA，SummarizedBenchmark |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | splatter_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | splatter_1.22.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | splatter_1.22.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | splatter_1.21.1.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/splatter |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/splatter/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
