spatialHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.spatialHeatmap

spatialHeatmap

Bioconductor版本:发行版(3.16)

spatialHeatmap包提供了可视化生物分析的细胞、组织和器官特定数据的功能，方法是根据数字颜色键为解剖图像中定义的相应空间特征着色。

作者:张建海[aut, trl, cre]， Jordan Hayes [aut]，张乐[aut]，杨冰[aut]， Wolf Frommer [aut]， Julia Bailey-Serres [aut]， Thomas Girke [aut]

维护人员:Jianhai Zhang

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("spatialHeatmap")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“spatialHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	用单细胞嵌入图共同可视化空间热图
超文本标记语言	R脚本	spatialHeatmap:在解剖图像和网络图中可视化空间分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ATACSeq，CellBasedAssays，CellBiology，聚类，DNASeq，DataRepresentation，GeneExpression，GeneTarget，GraphAndNetwork，微阵列，网络，测序，SingleCell，软件，空间，TissueMicroarray，可视化
版本	测试盒框
Bioconductor自	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	BiocParallel，BiocFileCache，data.table，dplyr，刨边机，WGCNA，flashClust，htmlwidgets，genefilter，ggplot2，ggdendro，grImport、网格gridExtra，gplots，igraph，limma、方法、矩阵，rsvg，闪亮的，dynamicTreeCutgrDevices图形,ggplotify平行,情节，rappdirs，reshape2，嘘，天窗，食物统计数据,SummarizedExperiment，SingleCellExperiment，shinydashboard，S4Vectors，宠物猫跑龙套,visNetwork，UpSetR，xml2，yaml
链接
建议	av，knitr，rmarkdown，BiocStyle，BiocSingular，RUnit，BiocGenerics，DESeq2，截然不同的，HDF5Array，kableExtra，魔法，ExpressionAtlas，DT，Biobase，GEOquery，pROC，的方式，shinyWidgets，shinyjs，htmltools，shinyBS，可分类的
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap
BugReports	https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	spatialHeatmap_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	spatialHeatmap_2.4.0.zip
macOS二进制(x86_64)	spatialHeatmap_2.4.0.tgz
macOS二进制(arm64)	spatialHeatmap_2.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spatialHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spatialHeatmap/
包下载报告	下载数据