Bioconductor版本:发行版(3.16)
从纳米孔读取DNA基因文库的精确一致序列。SINGLe纠正了基因文库的纳米孔测序读取中的系统错误,它检索了条形码识别的变体的真实一致序列,每个变体只需要几次读取。更多信息见预印本doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.25.007146。
维护者:Rocio Espada < Rocio . Espada at espci.fr>
引文(从R内,输入引用(“单一”)):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“单一”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 单 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
| biocViews | 测序,软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | Biostrings,BiocGenerics,dplyr,GenomicAlignments,IRanges、方法、reshape2,rlang,Rsamtools统计数据,stringr,tidyr,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | single_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | single_1.2.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | single_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | single_1.1.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/single |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/single/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |