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- Bioconductor 3.16
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- sechm
sechm
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DOI:10.18129 / B9.bioc.sechm
从SummarizedExperiment sechm:复杂的热图
Bioconductor版本:版本(3.16)
sechm SummarizedExperiment之间提供了一个简单的接口对象和ComplexHeatmap包。它使策划注释从SE对象的热图,构成了rowData colData列,容易获得和实现的特性使一代的热图更容易也更灵活。这些功能用于SEtools一揽子计划的一部分。
作者:Pierre-Luc日尔曼(cre, aut)
维护人员:Pierre-Luc日尔曼< Pierre-Luc。日尔曼在hest.ethz.ch >
从内部引用(R,回车引用(“sechm”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sechm”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“sechm”)
| HTML | R脚本 | sechm |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,软件,可视化 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | S4Vectors,SummarizedExperiment,系列化,ComplexHeatmap,circlize、方法、randomcoloR、统计数据、网格grDevices,matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/plger/sechm |
| 取决于我 | SEtools |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | sechm_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sechm_1.6.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | sechm_1.6.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | sechm_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sechm |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sechm |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sechm/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
