sSNAPPY

DOI:10.18129 / B9.bioc.sSNAPPY

单样本定向路径扰动分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

RNA-seq数据的单样本通路扰动测试方法。该方法传播基因表达向下基因集拓扑结构的变化，以计算反映潜在变化方向的单样本定向通路摄动分数。摄动评分可用于在个体样本和处理水平上测试通路摄动的显著性。

作者:刘文军[aut, cre]

维护者:刘文君<文君。刘在adelaide.edu.au>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“sSNAPPY”)

超文本标记语言	R脚本	单样本定向路径扰动分析
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细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，GeneSignaling，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	dplyr，magrittr，rlang统计数据,plyr，purrr，BiocParallel，石墨，Rcpp，宠物猫，ggplot2，ggraph，igraph，reshape2，org.Hs.eg.db，SummarizedExperiment，刨边机、方法
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	BiocManager，BiocStyle，cowplot，DT，knitr，老鸨，rmarkdown，拼写，stringr，testthat(> = 3.0.0),tidyverse
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://wenjun-liu.github.io/sSNAPPY/
BugReports	https://github.com/Wenjun-Liu/sSNAPPY/issues
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	sSNAPPY_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	sSNAPPY_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	sSNAPPY_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	sSNAPPY_1.1.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sSNAPPY
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sSNAPPY
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sSNAPPY/
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