Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包在r中实现了UbiBic算法。这个用于分析基因表达数据的聚类算法是由Zhenjia Wang等人在2016年提出的。它被认为是目前最有前途的聚类方法,用于识别复杂和噪声数据中的有意义结构。
作者:Patryk Orzechowski, Artur pazynczyk
维护者:Patryk Orzechowski < Patryk。Orzechowski在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“runibic”)):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("runibic")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“runibic”)
| 超文本标记语言 | runibic: R教程中的UniBic | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
| biocViews | 聚类,报道,GeneExpression,微阵列,测序,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.4.0),biclust,SummarizedExperiment |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.12),testthat、方法 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr,rmarkdown,GEOquery,affy,气道,QUBIC |
| SystemRequirements | c++ 11, GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | http://github.com/athril/runibic |
| BugReports | http://github.com/athril/runibic/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | mosbi |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | runibic_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | runibic_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/runibic |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/runibic |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/runibic/ |
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