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rprimer
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DOI:10.18129 / B9.bioc.rprimer
从多个DNA序列比对设计简并寡核苷酸
Bioconductor版本:发行版(3.16)
从多个DNA序列比对中可视化序列守恒和设计简并引物、探针和(RT)-(q/d)PCR分析的功能、工作流程和闪亮应用程序。结果可以以数据帧格式显示，并可视化为类似仪表板的图。欲了解更多信息，请参阅包装小插图。
作者:Sofia Persson [aut, cre]
维护者:Sofia Persson
引文(从R内，输入引用(“rprimer”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“rprimer”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 使用说明 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐，报道，MultipleSequenceAlignment，SequenceMatching，软件，ddPCR，qPCR |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | Biostrings，bslib，DT，ggplot2，IRanges，mathjaxr、方法、拼接而成，reshape2，S4Vectors，闪亮的，shinycssloaders，shinyFeedback |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，covr，kableExtra，knitr，rmarkdown，斯泰勒，testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/sofpn/rprimer |
| BugReports | https://github.com/sofpn/rprimer/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | rprimer_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rprimer_1.2.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | rprimer_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | rprimer_1.1.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rprimer |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rprimer |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rprimer/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
