RHDF5

doi：10.18129/b9.bioc.rhdf5

R接口到HDF5

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包在HDF5和R. HDF5的主要功能之间提供了一个接口，是能够通过完全便携式文件格式存储和/或复杂的数据集以及大量存储（磁盘）上的各种元数据。因此，RHDF5软件包适用于R和其他软件包之间的大型和/或复杂数据集的交换，以及让R应用程序在大于可用RAM的数据集上工作。

作者：Bernd Fischer [AUT]，Mike Smith [AUT，CRE]，Gregoire Pau [AUT]，Martin Morgan [CTB]，Daniel Van Twisk [CTB]

维护者：迈克·史密斯（Mike Smith）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ RHDF5”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ RHDF5”）

html	R脚本	在云中读取HDF5文件
html	R脚本	RHDF5 -HDF5接口R
html	R脚本	RHDF5实用提示
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，基础设施，，，，软件
版本	2.40.0
在生物导体中	Bioc 1.6（R-2.1）或更早（> 17年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0.0），方法
进口	Rhdf5lib（> = 1.13.4），RHDF5FILTERS
链接	Rhdf5lib
建议	位64，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，微实验，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，嘲弄
系统要求	gnu做
增强
URL	https://github.com/grimbough/rhdf5
BugReports	https://github.com/grimbough/rhdf5/issues
取决于我	Genogam，，，，GSCA，，，，HDF5Array，，，，打ic，，，，loomexpermiment，，，，Mudata
进口我	BAYESSPACE，，，，BGEECALL，，，，生物形式，，，，BNBC，，，，BSSEQ，，，，Citefuse，，，，cmapr，，，，COGAPS，，，，库务，，，，CRISPRSEEK，，，，CTRAP，，，，Cytomapper，，，，Diffhic，，，，dmelsgi，，，，液滴，，，，Epigrahmm，，，，EventPointer，，，，弗雷泽，，，，GenomicsCores，，，，gep2pep，，，，H5VC，，，，Hiccompare，，，，电离，，，，mafh5.gnomad.v3.1.1.grch38，，，，mafh5.gnomad.v3.1.2.grch38，，，，甲基Seqdata，，，，MOFA2，，，，nxtirfcore，，，，phantasus，，，，Ptairdata，，，，ptairms，，，，属属，，，，重新甲基化，，，，肋骨，，，，SCCB2，，，，烤饼，，，，SignaturesEarch，，，，signaturesearchdata，，，，TrackViewer
建议我	EDGER，，，，RHDF5FILTERS，，，，Scarray，，，，激流回旋，，，，光谱，，，，总结性特征，，，，tximport，，，，Zellkonverter
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rhdf5_2.40.0.tar.gz
Windows二进制	RHDF5_2.40.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	rhdf5_2.40.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rhdf5
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rhdf5
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rhdf5/
软件包下载报告	下载统计