phantasus

doi：10.18129/b9.bioc.phantasus

视觉和互动基因表达分析

生物导体版本：版本（3.15）

Phantasus是用于视觉和交互式基因表达分析的网络应用。Phantasus基于Morpheus，该软件是一种用于热图可视化和分析的软件，该软件通过OpenCPU API与R环境集成在一起。除了基本的可视化和过滤方法外，还支持基于R的方法，例如K-均值聚类，主成分分析或Limma软件包的差异表达分析。

作者：Daria Zenkova [aut]，Vladislav Kamenev [aut]，Rita Sablina [CTB]，Maxim Kleverov [CTB]，Maxim Artyomov [aut]，Alexey Sergushichichev [aut，Cre，Cre，Cre，CRE]

维护者：gmail.com上的Alexey Sergushichev

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Phantasus”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Phantasus”）

html	R脚本	使用Phantasus应用
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.16.2
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.5）
进口	GGPLOT2，，，，原石，，，，生物酶，，，，地球，，，，车，，，，htmltools，，，，httpuv，，，，jsonlite，，，，林玛，，，，OPENCPU，，，，断言， 方法，httr，，，，RHDF5，utils，并行，Stringr，，，，fgsea（> = 1.9.4），svglite，，，，gtable，统计矩阵，，，，pheatmap，，，，秤，，，，CCAPP，网格，grdevices，AnnotationDbi，，，，deseq2，，，，Data.Table，，，，卷曲
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://genome.ifmo.ru/phantasushttps://artyomovlab.wustl.edu/phantasus
BugReports	https://github.com/ctlab/phantasus/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	phantasus_1.16.2.tar.gz
Windows二进制	phantasus_1.16.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	phantasus_1.16.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phantasus
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/phantasus
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/phantasus/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档