enrichplot

DOI:10.18129 / B9.bioc.enrichplot

功能富集结果的可视化

Bioconductor版本:发行版(3.13)

“enrichment plot”包实现了几种可视化方法，用于解释从ORA或GSEA分析中获得的功能富集结果。所有的可视化方法都是基于“ggplot2”图形开发的。

作者:余光创[aut, cre]，胡尔强[ctb]

维护人员:Guangchuang Yu

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“enrichplot”)

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	cowplot，剂量(> = 3.16.0),ggplot2，ggraph、图形、网格igraph、方法、plyr，purrr，RColorBrewer，reshape2,统计,跑龙套,scatterpie，shadowtext，GOSemSim，magrittr，ggtree
链接
建议	clusterProfiler，dplyr，europepmc，ggupset，knitr，rmarkdown，org.Hs.eg.db，prettydoc，宠物猫，tidyr，ggforce，AnnotationDbi，ggplotify，ggridgesgrDevices,gridExtra，ggnewscale，ggrepel(> = 0.9.0),ggstar，treeio，尺度，tidytree
SystemRequirements
增强了
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/enrichplot/issues
取决于我	maEndToEnd
进口我	ChIPseeker，clusterProfiler，debrowser，ExpHunterSuite，MAGeCKFlute，网格，multiSight，ReactomePA
建议我	methylGSA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	enrichplot_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	enrichplot_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	enrichplot_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ enrichplot
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/enrichplot/
包下载报告	下载数据