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NanoStringQCPro
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringQCPro
NanoString mRNA基因表达数据的质量度量和数据处理方法
Bioconductor版本:Release (3.15)
NanoStringQCPro提供了一套质量指标，可用于评估NanoString mRNA基因表达数据的质量，即识别异常值探针和异常值样本。它还为这些数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出标记样本/探测的建议和易于共享的html质量控制输出。
作者:Dorothee Nickles < Nickles。dorothee at gene.com>， Thomas Sandmann < Sandmann。托马斯在gene.com>，罗伯特齐曼<齐曼。罗伯特在gene.com>，Richard Bourgon
维护者:Robert Ziman < Ziman。罗伯特在gene.com>
引文(从R内，输入引用(“NanoStringQCPro”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NanoStringQCPro”)
| vignetteNanoStringQCPro.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(>= 3.2)，方法 |
| 进口 | AnnotationDbi(> = 1.26.0),org.Hs.eg.db(> = 2.14.0),Biobase(> = 2.24.0),knitr(> = 1.12),NMF(> = 0.20.5),RColorBrewer(> = 1.0 5),png(> = 0.1 7) |
| 链接 | |
| 建议 | roxygen2(> = 4.0.1),testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NanoStringQCPro_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NanoStringQCPro_1.28.0.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NanoStringQCPro_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringQCPro |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringQCPro |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringQCPro/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
