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KEGGlincs
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DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGlincs
想象中的所有边缘KEGG通路和覆盖距离数据
Bioconductor版本:版本(3.15)
看看是怎么回事的引擎盖下面KEGG通路通过显式地重建信息从KGML获得文件的路径映射。
作者:Shana白
维护者:马里奥Medvedovic Shana白< vandersm mail.uc.edu >, < medvedm ucmail.uc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“KEGGlincs”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“KEGGlincs”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“KEGGlincs”)
| HTML | R脚本 | KEGGlincs工作流 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3),KOdata,hgu133a.db,org.Hs.eg.db(> = 3.3.0) |
| 进口 | AnnotationDbi,KEGGgraph,igraph,plyr,gtools,httr,RJSONIO,KEGGREST、方法、图形数据,跑龙套,XML,grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocManager(> = 1.20.3),knitr,图 |
| SystemRequirements | Cytoscape (> = 3.3.0), Java (> = 8) |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | KEGGlincs_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | KEGGlincs_1.22.0.zip(64位) |
| macOS 10.13(高山脉) | KEGGlincs_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KEGGlincs |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGlincs/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
