inpas
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doi：10.18129/b9.bioc.inpas
从RNA-seq数据中识别新型替代聚腺苷酸化位点（PA）的生物导体包装
生物导体版本：版本（3.13）
替代聚腺苷酸化（APA）是大多数人基因中发生的重要转录后调控机制之一。INPA促进了新型APA站点的发现和RNA-Seq数据中APA位点的差异使用。它利用清理updtseq通过删除错误站点来微调APA站点。
作者：Jianhong OU [AUT，CRE]，Haibo Liu [aut]，Lihua Julie Zhu [aut]，Sungmi M. Park [aut]，Michael R. Green [AUT]
维护者：jianhong ou
引用（从r内，输入引用（“ INPA”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ inpas”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ inpas”）
| html | R脚本 | INPAS小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.1），方法，生物酶，，，，基因组机，，，，S4VECTORS |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，BSGENOME，，，，清理，，，，预处理，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，DEPMIXS4，，，，林玛，，，，生物比较，，，，生物弦，，，，dplyr，，，，马格里特，，，，plyranges，，，，readr，，，，rsqlite，，，，DBI，，，，purrr，，，，GenomicFeatures，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2 |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，生物管理器，，，，rtracklayer，，，，生物使用，，，，尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，ensdb.hsapiens.v86，，，，ensdb.mmusculus.v79，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | inpas_2.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | inpas_2.0.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | inpas_2.0.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/inpas |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/inpas |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/inpas/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
