FastQCleaner
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doi：10.18129/b9.bioc.fastqCleaner
质量控制，过滤和修剪FASTQ文件的闪亮应用程序
生物导体版本：版本（3.15）
用于质量控制，过滤和修剪FASTQ文件的交互式Web应用程序。该用户友好的工具结合了基于生物弦和Shortread基础架构的数据处理的管道，并结合了尖端的视觉环境。单读和配对文件可以在本地处理。为输入文件和输出文件提供了诊断交互式图（CG内容，每个基数序列质量等）。
作者：Leandro Roser [AUT，CRE]，FernánAgüero[aut]，DanielSánchez[aut]
维护者：Leandro Roser
引用（从r内，输入引用（“ FastQCleaner”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ FastQCleaner”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ FastQCleaner”）
| R脚本 | FastQCleaner的简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.13.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | |
| 进口 | 方法，闪亮的，统计iranges，，，，生物弦，，，，Shortread，，，，DT，，，，S4VECTORS，图形，htmltools，，，，丝绸，，，，RCPP（> = 0.12.12） |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | FastQCleaner_1.13.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| MacOS 10.13（高山脉） | FastQCleaner_1.13.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fastqcleaner |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/fastqcleaner |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/fastqcleaner/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
