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- Bioconductor 3.16
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- ChromHeatMap
ChromHeatMap
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ChromHeatMap
热量由基因组地图绘制坐标
Bioconductor版本:版本(3.16)
ChromHeatMap包可以用来情节全基因组数据(如表情、全息、SNP)给定的每一链染色体热图。生成的热量地图可用于交互识别探测器和感兴趣的基因。
作者:蒂姆·f·雷纳
维护人员:蒂姆·f·雷纳< tfrayner gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“ChromHeatMap”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChromHeatMap”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ChromHeatMap”)
| R脚本 | 策划与ChromHeatMap表达数据 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.52.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(13岁) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.9.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0) |
| 进口 | Biobase(> = 2.17.8)、图形grDevices,方法,属性,IRanges,rtracklayer,GenomicRanges |
| 链接 | |
| 建议 | 所有,hgu95av2.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ChromHeatMap_1.52.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ChromHeatMap_1.52.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | ChromHeatMap_1.52.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | ChromHeatMap_1.52.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChromHeatMap |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChromHeatMap |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ChromHeatMap/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ChromHeatMap/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
