AnnotationHubData

DOI:10.18129 / B9.bioc.AnnotationHubData

将公共数据资源转换为Bioconductor数据结构

Bioconductor版本:发布(3.15)

这些配方将种类繁多且数量不断增长的公共生物信息学数据集转换为易于使用的标准Bioconductor数据结构。

作者:Martin Morgan[中文]，Marc Carlson[中文]，Dan Tenenbaum[中文]，Sonali Arora[中文]，Paul Shannon[中文]，Lori Shepherd[中文]，Bioconductor Package维护者[中文]

维护者:Bioconductor Package维护者< maintainer@bioconductor.org >

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AnnotationHubData")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“AnnotationHubData”)

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.26.1
在Bioconductor中	BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.2.2)， methods, utils，S4Vectors(> = 0.7.21),IRanges(> = 2.3.23),GenomicRanges，AnnotationHub(> = 2.15.15)
进口	GenomicFeatures，Rsamtools，rtracklayer，BiocGenerics，jsonlite，BiocManager，biocViews，BiocCheck，图，AnnotationDbi，Biobase，Biostrings，DBI，GenomeInfoDb(> = 1.15.4),OrganismDbi，RSQLite，AnnotationForge，futile.logger1.3.0(> =版本),XML，RCurl
链接
建议	RUnit，knitr，BiocStyle，grasp2db，GenomeInfoDbData，rmarkdown，HubPub
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	ExperimentHubData，ProteomicsAnnotationHubData
进口我	AHEnsDbs，EuPathDB
建议我	GenomicState，HubPub
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	AnnotationHubData_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	AnnotationHubData_1.26.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	AnnotationHubData_1.26.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/AnnotationHubData
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/AnnotationHubData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHubData/
软件包下载报告	下载数据
bioc3.15的旧源包	源存档