rWikiPathways

DOI:10.18129 / B9.bioc.rWikiPathways

rWikiPathways -用于WikiPathways API的R客户端库

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用这个包与WikiPathways API连接。它以多种数据和图像格式提供对WikiPathways内容的程序化访问，包括官方每月发布的文件和方便的GMT读写功能。

作者:Egon Willighagen，亚历克斯·皮科[au]

维护者:Egon Willighagen < Egon。在gmail.com willighagen >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rWikiPathways")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rWikiPathways”)

超文本标记语言	R脚本	1.概述
超文本标记语言	R脚本	2.rWikiPathways和BridgeDbR
超文本标记语言	R脚本	3.rWikiPathways和RCy3
超文本标记语言	R脚本	4.路径分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork，代谢组学，网络，软件，ThirdPartyClient，可视化
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	httr跑龙套,XML，rjson，data.table，tidyr，RCurl
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports	https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
取决于我
进口我	famat，multiSight，NoRCE，TimiRGeN
建议我	TRONCO
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rWikiPathways_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	rWikiPathways_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rWikiPathways_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	rWikiPathways_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rWikiPathways
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/
包下载报告	下载数据