qpgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph

从高通量基因组学数据估计遗传和分子调控网络

Bioconductor版本:发行版(3.16)

从高通量表达和基因分型分析中估计基因和eQTL网络。

作者:Robert Castelo [aut, cre]， Alberto Roverato [aut]

维护者:Robert Castelo < Robert。在upf.edu castelo >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("qpgraph")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qpgraph”)

PDF		BasicUsersGuide.pdf
PDF	R脚本	使用qpgraph估计eQTL网络
PDF	R脚本	利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程
PDF	R脚本	用qpgraph模拟分子调控网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneRegulation，GeneticVariability，遗传学，GraphAndNetwork，微阵列，NetworkInference，通路，单核苷酸多态性，软件，转录
版本	2.32.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(13.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5)
进口	方法、并行矩阵(> = 1.5 0)、网格注释，图(> = 1.45.1),Biobase，S4Vectors，BiocParallel，AnnotationDbi，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，GenomicFeatures，mvtnorm，qtl，Rgraphviz
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，genefilter，org.EcK12.eg.db，rlecuyer，雪，类别，GOstats
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rcastelo/qpgraph
BugReports	https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues
取决于我
进口我	限幅器
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qpgraph_2.32.0.tar.gz
Windows二进制	qpgraph_2.32.0.zip
macOS二进制(x86_64)	qpgraph_2.32.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qpgraph
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
包下载报告	下载数据