qPLEXanalyzer

DOI:10.18129 / B9.bioc.qPLEXanalyzer

定量蛋白质组学数据分析工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基于TMT的定量蛋白质组学数据分析工具。

作者:Matthew Eldridge [aut]， Kamal Kishore [aut]， Ashley Sawle [aut, cre]

维护人员:Ashley Sawle

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("qPLEXanalyzer")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qPLEXanalyzer”)

超文本标记语言	R脚本	qPLEXanalyzer
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，归一化，预处理，蛋白质组学，质量控制，软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0),Biobase，MSnbase
进口	为了，BiocGenerics，Biostrings，dplyr(> = 1.0.0),ggdendro，ggplot2、图形、grDevicesIRanges，limma，magrittr，preprocessCore，purrr，RColorBrewer，readr，rlang，尺度统计数据,stringr，宠物猫，tidyr，tidyselect,跑龙套
链接
建议	gridExtra，knitr，qPLEXdata，rmarkdown，testthat，UniProt.ws，vdiffr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/crukci-bioinformatics/qPLEXanalyzer/issues
取决于我	qPLEXdata
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qPLEXanalyzer_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	qPLEXanalyzer_1.16.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	qPLEXanalyzer_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	qPLEXanalyzer_1.15.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qPLEXanalyzer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qPLEXanalyzer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qPLEXanalyzer/
包下载报告	下载数据