钢琴
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DOI:10.18129 / B9.bioc.piano
组学数据的综合分析平台
Bioconductor版本:版本(3.16)
钢琴执行基因集使用各种统计分析方法,从不同的基因水平统计和广泛的基因片段的集合。此外,钢琴包包含函数结合基因集的多个运行分析的结果。
作者:列夫Varemo Wigge <钢琴。在gmail.com rpkg >和Intawat Nookaew
维护人员:列夫Varemo Wigge <钢琴。在gmail.com rpkg >
从内部引用(R,回车引用(钢琴)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“钢琴”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(钢琴)
| R脚本 | 钢琴——组学数据的综合分析平台 | |
| HTML | R脚本 | 运行与钢琴基因片段的分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,通路,预处理,质量控制,软件,可视化 |
| 版本 | 2.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (r - 3.0)(9.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | BiocGenerics,Biobase,gplots,igraph,关系,marray,fgsea,闪亮的,DT,htmlwidgets,shinyjs,shinydashboard,visNetwork,尺度grDevices图形,统计,跑龙套,方法 |
| 链接 | |
| 建议 | yeast2.db,rsbml,plotrix,limma,affy,钳子,affyPLM,gtools,biomaRt,降雪,AnnotationDbi,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.sysbio.se/piano |
| BugReports | https://github.com/varemo/piano/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | CoreGx,PDATK |
| 建议我 | BloodCancerMultiOmics2017,cosmosR |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | piano_2.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | piano_2.14.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | piano_2.14.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | piano_2.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/钢琴 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/piano/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
