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phenopath
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DOI:10.18129 / B9.bioc.phenopath
具有异质遗传和环境背景的基因组轨迹
Bioconductor版本:发行版(3.16)
PhenoPath在异质遗传和环境背景的存在下推断基因组轨迹(伪时间)，并测试它们之间的相互作用。
作者:基兰·坎贝尔
维护者:Kieran Campbell
引文(从R内，输入引用(“phenopath”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“phenopath”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，GeneExpression，ImmunoOncology，PrincipalComponent，RNASeq，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | Apache许可证(== 2.0) |
| 取决于 | |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.8),SummarizedExperiment，方法，统计，dplyr，宠物猫，ggplot2，tidyr |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr，rmarkdown，forcats，testthat，BiocStyle，SingleCellExperiment |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 飞溅 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | phenopath_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | phenopath_1.22.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | phenopath_1.22.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | phenopath_1.22.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenopath |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/phenopath |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phenopath/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
