Bioconductor版本:版本(3.16)
CNV检测目标门店面板数据的工具。cn的延伸。拖把包。
作者:Verena Haunschmid (aut) Gundula Povysil (aut (cre)
维护人员:Gundula Povysil < Povysil在bioinf.jku.at >
从内部引用(R,回车引用(“panelcn.mops”)):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“panelcn.mops”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“panelcn.mops”)
| R脚本 | panelcn.mops: Manual for the R package | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | CellBiology,CopyNumberVariation,遗传学,GenomicVariation,测序,软件,VariantDetection |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2.0) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),cn.mops、方法、跑龙套、统计数据、图形 |
| 进口 | GenomicRanges,Rsamtools,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb,grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | CopyNumberPlots |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | panelcn.mops_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | panelcn.mops_1.20.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | panelcn.mops_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | panelcn.mops_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panelcn.mops |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ panelcn.mops |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/panelcn.mops/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/panelcn.mops/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |