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openPrimeRui
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DOI:10.18129 / B9.bioc.openPrimeRui
在多重PCR引物设计与分析中的闪亮应用
Bioconductor版本:发行版(3.16)
一个闪亮的应用程序提供方法，设计，评估和比较引物集的多重聚合酶链反应。引物的设计是通过解决集合覆盖问题，使覆盖模板序列的数量以尽可能小的引物集最大化。为保证产生高质量的引物，只选择满足其理化性质约束的引物。
作者:Matthias Döring [aut, cre]， Nico Pfeifer [aut]
维护人员:Matthias Döring < Matthias -doering at gmx.de>
引用(从R中，输入引用(“openPrimeRui”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“openPrimeRui”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | openPrimeRui |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 软件，技术 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.0.0)，openPrimeR(> = 0.99.0) |
| 进口 | 闪亮的(> = 1.0.2中),shinyjs(> = 0.9),shinyBS(> = 0.61),DT(> = 0.2),rmarkdown(> = 1.0) |
| 链接 | |
| 建议 | knitr(> = 1.13) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | openPrimeRui_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | openPrimeRui_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | openPrimeRui_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | openPrimeRui_1.20.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/openPrimeRui |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openPrimeRui |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/openPrimeRui/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
