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ndexr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ndexr
NDEx R客户端库
Bioconductor版本:发行版(3.16)
这个包提供了一个到NDEx服务器的接口，例如http://ndexbio.org/的公共服务器。它可以通过API检索和保存网络。网络以RCX对象和图图表示形式提供。
作者:弗洛里安·奥尔<弗洛里安。auer at informatik. ini -augsburg.de>， Frank Kramer < Frank . Kramer at informatik. ini -augsburg.de>， Alex Ishkin
维护者:Florian Auer < Florian。Auer在informatik.uni-augsburg.de>
引文(从R内，输入引用(“ndexr”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ndexr”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | NDExR装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DataImport，网络，通路，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | BSD_3_clause |
| 取决于 | RCX |
| 进口 | httr，jsonlite，plyr，tidyr |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/frankkramer-lab/ndexr |
| BugReports | https://github.com/frankkramer-lab/ndexr/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | netgsa |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ndexr_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ndexr_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | ndexr_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | ndexr_1.19.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ndexr |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ndexr |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ndexr/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
