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mirTarRnaSeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.mirTarRnaSeq
mirTarRnaSeq
Bioconductor版本:发行版(3.16)
mirTarRnaSeq R包可用于交互式mRNA miRNA测序统计分析。该软件包利用表达或差异表达mRNA和miRNA测序结果，并在mRNA和miRNA实验之间进行交互相关和各种GLMs(常规GLM、多元GLM和交互GLMs)分析。这些实验可以是时间点实验，或者条件实验。
作者:mercedes deh Movassagh [aut, cre]
，萨拉·莫顿[aut]，拉斐尔·伊里扎里[aut]，杰弗里·贝利[aut]，约瑟夫·N·保尔森[aut]
维护:merdeh Movassagh < merdeh at dss.dfci.harvard.edu >
引用(从R中，输入引用(“mirTarRnaSeq”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mirTarRnaSeq")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“mirTarRnaSeq”)
| R脚本 | mirTarRnaSeq | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression，回归，测序，SmallRNA，软件，TimeCourse，microrna的 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.1.0),ggplot2 |
| 进口 | purrr，质量，pscl，为了，caTools，dplyr，pheatmap，reshape2，corrplot， grDevices，图形，统计，效用，data.table，R.utils |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，R.cache，海绵 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | mirTarRnaSeq_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mirTarRnaSeq_1.6.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | mirTarRnaSeq_1.6.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | mirTarRnaSeq_1.5.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mirTarRnaSeq |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mirTarRnaSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/mirTarRnaSeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
