微生物组

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiome

微生物分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

微生物组分析的实用程序。

作者:Leo Lahti， Sudarshan Shetty [au]

维护者:Leo Lahti < Leo。Lahti在iki.fi>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("microbiome")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(微生物)

超文本标记语言	R脚本	微生物组R包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	宏基因组，微生物组，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.20.0
在Bioconductor公司	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	bsd_clause +文件许可证
取决于	R (>= 3.6.0)，phyloseq，ggplot2
进口	Biostrings，作文，dplyr，reshape2，Rtsne，尺度统计数据,宠物猫，tidyr跑龙套,素食主义者
链接
建议	BiocGenerics，BiocStyle，开罗，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://microbiome.github.io/microbiome
BugReports	https://github.com/microbiome/microbiome/issues
全靠我
进口我
建议我	ANCOMBC
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	microbiome_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	microbiome_1.20.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiome
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/microbiome
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/microbiome/
软件包下载报告	下载数据