miaViz

DOI:10.18129 / B9.bioc.miaViz

微生物组分析、绘图和可视化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

miaViz包实现了绘图功能，在微生物组分析的上下文中与treesummarizeexperiment和相关对象一起工作。其中包括绘制树、图表和微生物组序列数据。该方案是更广泛的miaverse框架的一部分。

作者:Felix G.M. Ernst [au]， Tuomas Borman [aut, cre]， Leo Lahti [au]

维护者:Tuomas Borman < Tuomas .v。博尔曼在utu.fi >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("miaViz")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“miaViz”)

超文本标记语言	R脚本	miaViz
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	微生物组，软件，可视化
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0 |文件许可证
取决于	R (> = 4.0),SummarizedExperiment，TreeSummarizedExperiment，米娅(> = 0.99),ggplot2，ggraph(> = 2.0)
进口	方法、统计数据S4Vectors，BiocGenerics，BiocParallel，DelayedArray，嘘，ggtree，ggnewscale，冬青，宠物猫，tidytree，tidygraph，rlang，purrr，tidyr，dplyr，猿，DirichletMultinomial
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，拼接而成，microbiomeDataSets
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	miaViz_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	miaViz_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	miaViz_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	miaViz_1.5.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaViz
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miaViz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/miaViz/
包下载报告	下载数据