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methylInheritance
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DOI:10.18129 / B9.bioc.methylInheritance
基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来
Bioconductor版本:发行版(3.16)
基于蒙特卡罗抽样的排列分析，用于检验以下假设:几代之间保守的差异甲基化元素的数量与从处理中继承的效应有关，并且可以忽略随机效应。
作者:Astrid Deschênes [cre, aut]
，帕斯卡·贝洛[au]，阿诺·德罗伊特[au]
维护者:Astrid Deschênes
引文(从R内，输入引用(“methylInheritance”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“methylInheritance”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 基于置换的分析将多代保守差异甲基化元素与治疗效果联系起来 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BiologicalQuestion,DNAMethylation,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,StatisticalMethod,WholeGenome |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.5) |
| 进口 | methylKit,BiocParallel,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors，方法，并行，ggplot2,gridExtra,字谜 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,BiocGenerics,knitr,rmarkdown,RUnit,methInheritSim |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/adeschen/methylInheritance |
| BugReports | https://github.com/adeschen/methylInheritance/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | methInheritSim |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | methylInheritance_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | methylInheritance_1.22.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | methylInheritance_1.22.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | methylInheritance_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylInheritance |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/methylInheritance |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/methylInheritance/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/methylInheritance/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
