石墨
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DOI:10.18129 / B9.bioc.graphite
路径拓扑环境的相互作用
Bioconductor版本:发行版(3.16)
路径拓扑的图对象来源于KEGG、Panther、PathBank、PharmGKB、Reactome SMPDB和WikiPathways数据库。
作者:Gabriele Sales [cre]， Enrica Calura [aut]， Chiara Romualdi [aut]
维护者:Gabriele Sales < Gabriele。销售unipd.it >
引用(从R中，输入引用(石墨))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("graphite")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(石墨)
| R脚本 | 路径拓扑环境的相互作用 | |
| metabolites.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GraphAndNetwork，KEGG，代谢组学，网络，通路，Reactome，软件，ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.44.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (R-2.14)(11年) |
| 许可证 | AGPL-3 |
| 取决于 | R(>= 4.2)，方法 |
| 进口 | AnnotationDbi，图(> = 1.67.1),httr，rappdirs，统计，utils，图形，rlang，purrr |
| 链接 | |
| 建议 | 使彻底失败，a4Preproc，所有，BiocStyle，限幅器，codetools，hgu133plus2.db，hgu95av2.db，嫁祸于，knitr，org.Hs.eg.db平行,R.rsp，RCy3，rmarkdown，SPIA(> = 2.2),testthat，topologyGSA(> = 1.4.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/sales-lab/graphite |
| BugReports | https://github.com/sales-lab/graphite/issues |
| 取决于我 | PoTRA |
| 进口我 | dce，EnrichmentBrowser，mogsa，multiGSEA，ReactomePA，sSNAPPY，StarBioTrek |
| 建议我 | 限幅器，InterCellar，metaboliteIDmapping |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | graphite_1.44.0.tar.gz |
| Windows二进制 | graphite_1.44.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | graphite_1.44.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | graphite_1.43.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graphite |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/石墨 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/graphite/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
