ggmanh

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggmanh

GWAS结果可视化工具

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Manhattan plot和QQ plot是全基因组关联研究(Genome Wide Association Study)的常用可视化方法。“ggmanh”包旨在保持这些图的生成简单，同时保持可定制性。主要函数包括曼哈顿an_plot、qqunif和thinPoints。

作者:John Lee [aut, cre]，郑秀文[ctb, dtc]

维护者:John Lee < John。李在abbvie.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ggmanh")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ggmanh”)

超文本标记语言	R脚本	ggmanh包装指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学，GenomeWideAssociation，软件，可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	方法,ggplot2
进口	gdsfmt，ggrepelgrDevices,RColorBrewer，rlang，尺度，SeqArray(> = 1.32.0),统计数据
链接
建议	BiocStyle，rmarkdown，knitr，testthat(> = 3.0.0),减价，GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	SAIGEgds
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ggmanh_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	ggmanh_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ggmanh_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ggmanh_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggmanh
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggmanh
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ggmanh/
包下载报告	下载数据