逃避
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DOI:10.18129 / B9.bioc.escape
简单的单细胞富集分析平台
Bioconductor版本:发行版(3.16)
一种桥接R包，以促进单细胞RNA测序背景下的基因集富集分析(GSEA)。使用原始计数信息、Seurat对象或singlecel实验格式，用户可以跨单个单元执行和可视化GSEA。
作者:Nick Borcherding [aut, cre]， Jared Andrews [aut]
维护者:Nick Borcherding
引文(从R内，输入引用(“逃离”)):
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“逃离”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Escape-ingToWork |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,分类,GeneSetEnrichment,GeneSignaling,通路,测序,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | grDevices,dplyr,ggplot2,GSEABase,GSVA,SingleCellExperiment,ggridges,msigdbr统计数据,BiocParallel,矩阵,UCell,扫帚,reshape2,拼接而成,MatrixGenerics跑龙套,rlang,stringr,data.table,SummarizedExperiment、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 修拉,SeuratObject,knitr,rmarkdown,减价,BiocStyle,testthat,dittoSeq(> = 1.1.2) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Cepo |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | escape_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | escape_1.8.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | escape_1.8.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/escape |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/escape/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
