epivizrStandalone

DOI:10.18129 / B9.bioc.epivizrStandalone

在R中运行Epiviz交互式基因组数据可视化应用程序

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包导入了用于基因组数据交互可视化的epiviz可视化JavaScript应用程序。'epivizrServer'包用于提供一个完全在r中运行的web服务器。这个独立版本允许通过Bioconductor包提供的基因组注释浏览任意基因组。

作者:Hector Corrada Bravo, Jayaram Kancherla

维护者:Hector Corrada Bravo

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“epivizrStandalone”)

超文本标记语言		epivizrStandalone简介
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GUI，基础设施，软件，可视化
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(6.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.2.3)，epivizr(>= 2.3.6)，方法
进口	git2r，epivizrServer，GenomeInfoDb，BiocGenerics，GenomicFeatures，S4Vectors
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，OrganismDbi(> = 1.13.9),Mus.musculus，Biobase，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	metavizr
建议我	scTreeViz
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	epivizrStandalone_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	epivizrStandalone_1.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	epivizrStandalone_1.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	epivizrStandalone_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epivizrStandalone
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epivizrStandalone
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/epivizrStandalone/
软件包下载报告	下载数据