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epiNEM
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DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM
epiNEM
Bioconductor版本:发行版(3.16)
epiNEM是原始嵌套效应模型(NEM)的扩展。EpiNEM能够考虑双重敲除，并推断出更复杂的网络信号通路。它是为大规模双淘汰屏幕量身定制的。
作者:Madeline Diekmann & Martin Pirkl
维护者:Martin Pirkl
引文(从R内，输入引用(“epiNEM”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“epiNEM”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | epiNEM |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 网络，NetworkInference，通路，软件，SystemsBiology |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | BoolNet，e1071，gtools统计数据,igraph跑龙套,晶格，latticeExtra，RColorBrewer，pcalg，minetgrDevices,图，mnem，latex2exp |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，RUnit，BiocGenerics，STRINGdb，devtools，rmarkdown，GOSemSim，AnnotationHub，org.Sc.sgd.db |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/ |
| BugReports | https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | bnem，dce，nempi |
| 建议我 | mnem |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | epiNEM_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | epiNEM_1.22.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | epiNEM_1.22.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | epiNEM_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/epiNEM |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/epiNEM/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/epiNEM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
