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cydar
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cydar
用质量细胞仪进行差异丰度分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
在大规模细胞术数据中识别样本和组之间差异丰富的群体。提供用于将细胞计数为超球、控制空间错误发现率以及在高维标记空间中可视化丰度变化的方法。
作者:Aaron Lun [aut, cre]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内，输入引用(“cydar”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“cydar”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 差异丰度检测 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | FlowCytometry，ImmunoOncology，MultipleComparison，蛋白质组学，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | SingleCellExperiment |
| 进口 | 冬青、方法、闪亮的，图形，统计，grDevices, utils，BiocGenerics，S4Vectors，BiocParallel，SummarizedExperiment，flowCore，Biobase，Rcpp，BiocNeighbors |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | ncdfFlow，testthat，rmarkdown，knitr，刨边机，limma，glmnet，BiocStyle，flowStats |
| SystemRequirements | c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | cydar_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cydar_1.22.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | cydar_1.22.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | cydar_1.22.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cydar |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cydar |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/cydar/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cydar/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
