cosmiq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmiq

cosmiq -将单个质量组合成数量

Bioconductor版本:发行版(3.16)

cosmiq是一种用于液相色谱或气相色谱质谱(LCMS/GCMS)数据预处理的工具，专注于代谢组学或脂质组学应用。为了提高对低丰度信号的检测，cosmiq在应用峰值检测算法之前，从所有获得的运行中生成mZ/RT空间的主地图。与分别在每个LCMS/GCMS文件中进行峰值拾取的传统方法相比，其结果是对低强度MS信号进行更可靠的识别和量化。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构之上，因此可以作为备选预处理步骤与包xcms很好地集成。

作者:David Fischer [aut, cre]， Christian Panse [aut]，拉茨科[ctb]

维护者:David Fischer

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cosmiq”)

PDF	R脚本	cosmiq底漆
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(8.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)，Rcpp
进口	pracma，xcms，MassSpecWavelet，faahKO
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cosmiq_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	cosmiq_1.32.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	cosmiq_1.32.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	cosmiq_1.32.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cosmiq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/cosmiq/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/
软件包下载报告	下载数据