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cellxgenedp
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DOI:10.18129 / B9.bioc.cellxgenedp
在cellxgene数据门户中发现和访问单细胞数据集
Bioconductor版本:发行版(3.16)
cellxgene数据门户(https://cellxgene.cziscience.com/)为以标准方式处理的单细胞序列数据集合提供了一个图形用户界面，以“计数矩阵”摘要。cellxgenedp包提供了一个可选的、基于r的接口，允许数据发现、查看和下载。
作者:Martin Morgan [aut, cre]
，凯拉·Interdonato [au]
维护人员:Martin Morgan
引用(从R中，输入引用(“cellxgenedp”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cellxgenedp")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“cellxgenedp”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 发现和下载数据集和文件从cellxgene数据门户 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataImport，SingleCell，软件，ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | dplyr |
| 进口 | httr，旋度，jsonlite,跑龙套,工具,闪亮的，DT，rjsoncons |
| 链接 | |
| 建议 | zellkonverter，SingleCellExperiment，HDF5Array，BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0),嘲笑 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | cellxgenedp_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | cellxgenedp_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | cellxgenedp_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | cellxgenedp_1.1.5.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellxgenedp |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cellxgenedp |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cellxgenedp/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
