cbaf

DOI:10.18129 / B9.bioc.cbaf

自动比较来自cbioportal.org的各种omic数据的功能

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包包含的功能可以方便地分析和比较各种癌症/癌症亚组的组学数据。到目前为止，它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq, microRNA-seq，微阵列和甲基化数据集兼容。

作者:Arman Shahrisa [aut, cre, cph]， Maryam Tahmasebi Birgani [aut]

维护者:Arman Shahrisa < Shahrisa。Arman在hotmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cbaf”)

超文本标记语言	R脚本	cbaf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AssayDomain，BiomedicalInformatics，ComparativeGenomics，DNAMethylation，表观遗传学，GeneExpression，遗传学，微阵列，ResearchField，软件，转录，转录组
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)
进口	BiocFileCache，RColorBrewer，cBioPortalData，genefilter，gplots， grDevices, stats, utils，openxlsx
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cbaf_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	cbaf_1.20.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	cbaf_1.20.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cbaf
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cbaf/
软件包下载报告	下载数据