癌症
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DOI:10.18129 / B9.bioc.canceR
用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面
Bioconductor版本:发行版(3.16)
该包是基于cgdsr和其他建模包的用户友好界面，用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白质磷酸化、拷贝数改变)，由Memorial-Sloan-Kettering癌症中心(MSKCC)的计算生物学中心托管。
作者:Karim Mezhoud。核安全保障部。突尼斯核科学中心。
维护者:Karim Mezhoud
引文(从R内，输入引用(“癌症”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("canceR")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“癌症”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 癌症:用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类，去，GUI，GeneExpression，GeneSetEnrichment，KEGG，MultipleComparison，软件 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 4.1)， tcltk |
| 进口 | GSEABase，tkrplot，geNetClassifier，RUnit，公式，rpart，生存，Biobase，phenoTest，circlize，plyr，图形，统计，utils, grDevices，R.oo，R.methodsS3，httr |
| 链接 | |
| 建议 | testthat(> = 3.1),knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | Tktable, BWidget |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/kmezhoud/canceR/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | canceR_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | canceR_1.32.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | canceR_1.32.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | canceR_1.31.01.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/canceR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/canceR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
