北欧化工

DOI:10.18129 / B9.bioc.borealis

亚硫酸盐序列离群值甲基化在单点分辨率

Bioconductor版本:发行版(3.16)

Borealis是一个R库，用于对基于计数的亚硫酸氢盐测序数据进行离群值分析。它从亚硫酸氢盐测序(BS-seq)中检测异常的甲基化CpG位点。Borealis的核心是建模-二项分布。这对罕见疾病的诊断很有用。

作者:Garrett Jenkinson [aut, cre]

维护人员:Garrett Jenkinson

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("borealis")

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文档

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超文本标记语言	R脚本	北方离群值甲基化检测
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细节

biocViews	报道，DNAMethylation，DifferentialMethylation，测序，软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0),Biobase
进口	doParallel，雪，purrr，plyr，foreach，gamlss，gamlss.dist，bsseq、方法、DSS，R.utils,跑龙套,统计数据,ggplot2，cowplot，dplyr，rlang，GenomicRanges
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics，annotatr，tidyr，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	borealis_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	borealis_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	borealis_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	borealis_1.1.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/borealis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/好
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/borealis/
包下载报告	下载数据