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bnbc
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DOI:10.18129 / B9.bioc.bnbc
Bandwise正常化和批处理高c数据的修正
Bioconductor版本:版本(3.16)
规范化的工具(几个)高c的数据复制。
作者:腌Fletez-Brant (cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)
维护人员:腌Fletez-Brant < cafletezbrant gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“bnbc”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bnbc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“bnbc”)
| HTML | R脚本 | bnbc用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 嗝,归一化,预处理,软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 3.5.0)、方法BiocGenerics,SummarizedExperiment,GenomicRanges |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.12),IRanges,rhdf5,data.table,GenomeInfoDb,S4Vectors,matrixStats,preprocessCore,股东价值分析平行,EBImage,跑龙套 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/hansenlab/bnbc |
| BugReports | https://github.com/hansenlab/bnbc/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | bnbc_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bnbc_1.20.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | bnbc_1.20.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | bnbc_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bnbc |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/bnbc/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bnbc/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
