Bioconductor版本:发行版(3.16)
biodbKegg库是biodb框架包的扩展,提供访问KEGG数据库化合物,酶,基因,模块,Orthology和反应。它允许根据条目的登录号检索条目。像“查找”、“列表”和“findExactMass”这样的Web服务也可用。还实现了一些沿着路径导航的功能。
维护者:Pierrick Roger < Pierrick。收到,在cea.fr>
引文(从R内,输入引用(“biodbKegg”)):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biodbKegg”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 介绍biodbKegg包。 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | DataImport,基础设施,KEGG,通路,软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | AGPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1) |
| 进口 | R6,biodb(> = 1.4.2),嗯,生命周期 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,roxygen2,devtools,testthat(> = 2.0.0),knitr,rmarkdown,igraph,魔法,lgr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/pkrog/biodbKegg |
| BugReports | https://github.com/pkrog/biodbKegg/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | biodbKegg_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | biodbKegg_1.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | biodbKegg_1.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbKegg |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biodbKegg |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biodbKegg/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |