biodbHmdb

DOI:10.18129 / B9.bioc.biodbHmdb

用于连接到HMDB数据库的库

Bioconductor版本:发行版(3.16)

biodbHmdb库是biodb框架包的扩展，提供对HMDB代谢物数据库的访问。它允许在本地下载整个HMDB代谢物数据库，访问条目并通过名称或描述搜索条目。该软件包的未来版本还将包括质量搜索和质谱注释。

作者:Pierrick Roger [aut, cre]

维护者:Pierrick Roger < Pierrick。收到，在cea.fr>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“biodbHmdb”)

超文本标记语言	R脚本	biodbHmdb包的介绍。
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	1.4.0
在Bioconductor	bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (>= 4.1)
进口	R6，biodb(> = 1.3.2),Rcpp
链接	Rcpp，testthat
建议	BiocStyle，roxygen2，devtools，testthat(> = 2.0.0),knitr，rmarkdown，covr，lgr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pkrog/biodbHmdb
BugReports	https://github.com/pkrog/biodbHmdb/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	biodbHmdb_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	biodbHmdb_1.4.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	biodbHmdb_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	biodbHmdb_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbHmdb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biodbHmdb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biodbHmdb/
软件包下载报告	下载数据