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bandle
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DOI:10.18129 / B9.bioc.bandle
差分亚细胞定位实验贝叶斯分析的R包
Bioconductor版本:发行版(3.16)
Bandle包可以使用质谱数据对差分定位实验进行分析和可视化。支持的实验方法包括动态LOPIT-DC, hyperLOPIT, dynamic Organellar Maps, dynamic PCP。它提供了Bioconductor基础设施来分析这些数据。
作者:奥利弗·m·克鲁克[aut, cre]
，丽莎·布雷克尔斯[au]
维护者:Oliver M. Crook < Oliver。骗子在stats.ox.ac.uk>
引文(从R内，输入引用(“bandle”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“bandle”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用BANDLE分析微分定位实验:小插图1 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 用BANDLE分析微分定位实验:小插图2 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，分类，聚类，DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，质量控制，软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 4.1)，S4Vectors，Biobase，MSnbase，pRoloc |
| 进口 | Rcpp(> = 1.0.4.6),pRolocdata，lbfgs，ggplot2，dplyr，plyr，knitr、方法、BiocParallel，robustbase，BiocStyle，ggalluvial，ggrepel，tidyr，circlize，图形，统计，utils, grDevices，rlang |
| 链接 | Rcpp，RcppArmadillo，黑洞 |
| 建议 | coda(> = 0.19 4),testthat，插值函数，字段，pheatmap，冬青，rmarkdown，拼写 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://github.com/ococrook/bandle |
| BugReports | https://github.com/ococrook/bandle/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | bandle_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | bandle_1.2.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | bandle_1.2.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | bandle_1.2.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bandle |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bandle |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bandle/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
